The introduction of RT-LAMP method and comparison of its sensitivity with RT-qPCR in the detection of Chikungunya virus

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F70565813%3A_____%2F13%3A%230000291" target="_blank" >RIV/70565813:_____/13:#0000291 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The introduction of RT-LAMP method and comparison of its sensitivity with RT-qPCR in the detection of Chikungunya virus

Popis výsledku v původním jazyce

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel nucleic acid amplification method and has the potential to compete with PCR because of its simplicity, rapidity, specificity, and cost-effectiveness. The reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay has emerged as a powerful gene amplification tool for the rapid identification of microbial infections and is being increasingly used for rapid detection and typing of emerging viruses, for example the Chikungunya virus,West Nile virus, dengue virus etc. The detection of gene amplification can be accomplished by either agarose gel electrophoresis or by real-time monitoring in the turbidimeter. Moreover, the gene amplifification can be eye-visualized either by formationof the white precipitate or by using fluorescent intercalating dye (e.g. SYTO) and UV lamp. Because the LAMP method uses a Bst DNA polymerase long fragment, the reaction can be carried out under isothermal conditions in the water bath or

Název v anglickém jazyce

The introduction of RT-LAMP method and comparison of its sensitivity with RT-qPCR in the detection of Chikungunya virus

Popis výsledku anglicky

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel nucleic acid amplification method and has the potential to compete with PCR because of its simplicity, rapidity, specificity, and cost-effectiveness. The reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay has emerged as a powerful gene amplification tool for the rapid identification of microbial infections and is being increasingly used for rapid detection and typing of emerging viruses, for example the Chikungunya virus,West Nile virus, dengue virus etc. The detection of gene amplification can be accomplished by either agarose gel electrophoresis or by real-time monitoring in the turbidimeter. Moreover, the gene amplifification can be eye-visualized either by formationof the white precipitate or by using fluorescent intercalating dye (e.g. SYTO) and UV lamp. Because the LAMP method uses a Bst DNA polymerase long fragment, the reaction can be carried out under isothermal conditions in the water bath or

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/VF20112015013" target="_blank" >VF20112015013: Výzkum moderních metod detekce a identifikace nebezpečných CBRN látek a materiálů, metod snížení jejich nebezpečnosti a dekontaminace; výzkum moderních prostředků ochrany osob a prvků kritické infrastruktury</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

26. KONGRES ČESKOSLOVENSKÉ SPOLEČNOSTI MIKROBIOLOGICKÉ

ISBN

978-80-260-4507-6

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

163

Název nakladatele

Československá společnost mikrobiologická

Místo vydání

Praha-Bratislava

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

1. 1. 2013

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—