Identification of 50 class D beta-lactamases and 65 Acinetobacter-derived cephalosporinases in Acinetobacter spp.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F75010330%3A_____%2F14%3A00010668" target="_blank" >RIV/75010330:_____/14:00010668 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://aac.asm.org/content/58/2/936" target="_blank" >http://aac.asm.org/content/58/2/936</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1128/AAC.01261-13" target="_blank" >10.1128/AAC.01261-13</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Identification of 50 class D beta-lactamases and 65 Acinetobacter-derived cephalosporinases in Acinetobacter spp.
Popis výsledku v původním jazyce
Whole-genome sequencing of a collection of 103 Acinetobacter strains belonging to 22 validly named species and another 16 putative species allowed detection of genes for 50 new class D beta-lactamases and 65 new Acinetobacter-derived cephalosporinases (ADC). All oxacillinases (OXA) contained the three typical motifs of class D beta-lactamases, STFK, (F/Y) GN, and K(S/T) G. The phylogenetic tree drawn from the OXA sequences led to an increase in the number of OXA groups from 7 to 18. The topologies of the OXA and RpoB phylogenetic trees were similar, supporting the ancient acquisition of bla(OXA) genes by Acinetobacter species. The class D beta-lactamase genes appeared to be intrinsic to several species, such as Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter calcoaceticus, and Acinetobacter lwoffii. Neither bla(OXA-40/143)-nor bla(OXA-58)-like genes were detected, and their origin remains therefore unknown. The phylogenetic tree analysis based on the alignment of the seque
Název v anglickém jazyce
Identification of 50 class D beta-lactamases and 65 Acinetobacter-derived cephalosporinases in Acinetobacter spp.
Popis výsledku anglicky
Whole-genome sequencing of a collection of 103 Acinetobacter strains belonging to 22 validly named species and another 16 putative species allowed detection of genes for 50 new class D beta-lactamases and 65 new Acinetobacter-derived cephalosporinases (ADC). All oxacillinases (OXA) contained the three typical motifs of class D beta-lactamases, STFK, (F/Y) GN, and K(S/T) G. The phylogenetic tree drawn from the OXA sequences led to an increase in the number of OXA groups from 7 to 18. The topologies of the OXA and RpoB phylogenetic trees were similar, supporting the ancient acquisition of bla(OXA) genes by Acinetobacter species. The class D beta-lactamase genes appeared to be intrinsic to several species, such as Acinetobacter baumannii, Acinetobacter pittii, Acinetobacter calcoaceticus, and Acinetobacter lwoffii. Neither bla(OXA-40/143)-nor bla(OXA-58)-like genes were detected, and their origin remains therefore unknown. The phylogenetic tree analysis based on the alignment of the seque
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA13-26693S" target="_blank" >GA13-26693S: Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Antimicrobial Agents and Chemotherapy
ISSN
0066-4804
e-ISSN
—
Svazek periodika
58
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
936-949
Kód UT WoS článku
000330637500039
EID výsledku v databázi Scopus
—