Stanovení E. coli metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F75010330%3A_____%2F22%3A00014174" target="_blank" >RIV/75010330:_____/22:00014174 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://szu.cz/odborna-centra-a-pracoviste/centrum-zdravi-a-zivotniho-prostredi/ohv/projekty-oddeleni-hygieny-vody/vyuziti-metod-molekularni-biologie-k-identifikaci-zdroju-znecisteni-v-koupacich-vodach" target="_blank" >https://szu.cz/odborna-centra-a-pracoviste/centrum-zdravi-a-zivotniho-prostredi/ohv/projekty-oddeleni-hygieny-vody/vyuziti-metod-molekularni-biologie-k-identifikaci-zdroju-znecisteni-v-koupacich-vodach</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Stanovení E. coli metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (qPCR)
Popis výsledku v původním jazyce
Jedná se molekulárně biologickou metodu stanovení E. coli z matrice koupací voda. Principem zkoušky je izolace DNA z uměle připravených nebo neznámých přírodních vzorků pomocí některého z komerčních kitů (např. PowerSoil (Qiagen), PowerWater (Qiagen) apod.) a následné mnohonásobné namnožení specifického úseku DNA (v našem případě části genu pro 16S rRNA) a detekce množství DNA vznikající v každém cyklu qPCR reakce. Detekce množství DNA je umožněno měřením hladiny fluorescence substrátu, který se váže na nově vznikající DNA úseky. Hladina fluorescence tedy odráží množství přítomné DNA.
Název v anglickém jazyce
Detection and quantification of E. coli by quantitative polymerase chain reaction (qPCR)
Popis výsledku anglicky
This is a molecular biology method for the determination of E. coli from a bathing water matrix. The principle of the test is to isolate DNA from artificially prepared or unknown natural samples using one of the commercial kits (e.g. PowerSoil (Qiagen), PowerWater (Qiagen), etc.) and then to reproduce a specific stretch of DNA (in our case a part of the 16S rRNA gene) several times and detect the amount of DNA produced in each cycle of the qPCR reaction. The detection of the amount of DNA is made possible by measuring the fluorescence level of the substrate that binds to the newly emerging DNA stretches. Thus, the fluorescence level reflects the amount of DNA present.
Klasifikace
Druh
N<sub>metA</sub> - Akreditované metodiky a postupy
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/TJ04000132" target="_blank" >TJ04000132: Využití metod molekulární biologie k identifikaci zdrojů znečištění v koupacích vodách</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
SOP č. 48/1.1
Číslo předpisu
osvědčení o akreditaci č. 561/2022
Technické parametry
Stanovení E. coli z koupacích vod metodou qPCR. Metodika je vlastnictvím Státního zdravotního ústavu. S autory metodiky je možné metodiku konzultovat a nahlížet do ní.
Ekonomické parametry
Rozšíření portfolia akreditovaných metod Oddělení hygieny vody SZÚ.
Označení certifikačního orgánu
Český institut pro akreditaci, o.p.s., Olšanská 54/3, 130 00 Praha 3
Datum certifikace
—
Způsoby využití výsledku
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel