Studium kódu CTD RNA polymerázy II

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-18344S

Název projektu anglicky

Towards the understanding of the CTD code of RNA Polymerase II

Anotace anglicky

I propose to decipher the basic rules that govern the readout of the CTD code of RNA polymerase II (RNAPII) by processing factors. The concept of the CTD code that specifies the position of RNAPII in the transcriptional cycle and thus recruits specific processing factors, was suggested almost a decade ago. Previous X-ray crystallography attempts to reveal the CTD structure and its interaction with multiple binding factors were unsuccessful due to flexibility of the CTD and its weak binding affinity to processing factors. We will determine the NMR structures of several processing factors bound to the CTD with various modification marks. Thanks to the recent development of SAXS that can be combined with a high resolution NMR structures of weak complexes, we will answer the long-standing question of how the overall CTD structure is modulated upon binding of processing factors. The use of this technology will provide entirely new structural information that will go significantly beyond the state of the art in the research fields of transcription and RNA processing.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Signifikantní výsledky, které odpovídají nejnáročnějším kritériím na excelentní výzkum, potvrzeny publikacemi ve špičkových časopisech. Důležitý příspěvek k objasnění našeho porozumění kódu CTD RNA polymerázy II.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

12 739 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

12 739 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč