Protínání hranic: analýza funkčních mRNA elementů zajišťujících mechanismus translační reiniciace v nižších i vyšších eukaryontech.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-10116S

Název projektu anglicky

Crossing the boundaries: analysis of functional mRNA elements determining the mechanism of translational reinitiation in lower and higher eukaryotes.

Anotace anglicky

Translation is a fundamental process critically contributing to regulation of gene expression. One of the extensively studied mechanisms of gene-specific translational regulation is reinitiation (REI). It takes place on mRNAs where main ORF is preceded by short upstream ORF (uORF). It is characterized by the ability of some of these short uORFs to retain 40S ribosomal subunits on the same mRNA molecule even after they have been translated, so that 40S can resume scanning for the next start codon. Two transcription factors, yeast GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4, represent the best studied examples of REI. Yet the molecular-mechanistic details of all events that lead to successful REI are still not understood. Here we plan to analyze the interactions between REI promoting cis-elements preceding GCN4 REI permissive uORFs with their specific trans-factors by using a wide range of in vivo and in vitro techniques. We will also explore the degree of conservation of basic principles of REI across the species by elucidating the molecular strategy employed by human ATF4.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přispěl k dalšímu pochopení molekulárních mechanismů reiniciace translace u vyšších organismů. Cíle projektu byly naplněny a výsledkem jsou dvě originální publikace a jeden přehledový článek, dva ve vynikajících časopisech. Projekt významně přispěl k výchově PhD studentů.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

6 795 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 795 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč