Struktura DNA v roztoku a na površích elektrod: elektrochemické metody jako účinné nástroje analýzy struktury a interakcí DNA.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-01625S

Název projektu anglicky

DNA structure in solution and at electrode surfaces: electrochemical methods as potent tools for the analysis of DNA structure and interactions.

Anotace anglicky

Previous research revealed excellent properties of the electrochemical methods in studies of DNA structure and interactions, particularly in studies and applications involving structural changes of double-helical DNA, DNA damage and hybridization. This project is focused on extension of this knowledge towards electrochemical properties of alternative DNA structures, such as non-canonical DNA duplexes, guanine and cytosine quadruplexes. We will use earlier described structural transitions of specific nucleotide sequences (including natural ones, such as telomere repeats) to find the relation between formation of the given structure in solution and its behavior at electrode surfaces, its stability upon exposure to electric field, and accessibility of specific nucleobase residues for reduction or oxidation processes. Effects of nucleobase exchanges, chemical modification and interaction with structure-specific ligands will be investigated. Based on results of these studies, novel techniques for electroanalysis of DNA structure studies will be designed.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CG - Elektrochemie

CEP - vedlejší obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Většina původních cílů schválených v projektu byla splněna. Byly získány nové informace ohledně chování homonukleotidů na záporně nabitém povrchu elektrody včetně absorpčního/desorpčního jevu a redukčních vlastnostech cytosinu v homonukleotidech při vysokém pH. Závěry rozšiřují znalosti o chování různých nukleových kyselin na elektricky nabitém povrchu.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

29. 11. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2020

Celkové uznané náklady

4 476 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 281 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

195 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč