Strukturní a biofyzikální podstata reakčního mechanismu intramembránové proteolysy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-09556S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structural and biophysical basis of the reaction mechanism of intramembrane proteolysis
Anotace anglicky
Intramembrane proteases (IMPRs) regulate a number of biological processes and are implicated in human diseases. In contrast to their importance and ubiquity, they are only poorly understood mechanistically. Crystal structures of representative IMPRs have shown the location of their membrane-buried active sites, but have not revealed the principles of substrate discrimination and dynamic aspects of the mechanism. Using rhomboid IMPRs as a model, we propose using a combination of enzymology, X-ray crystallography, NMR spectroscopy with molecular modelling, and fluorescence techniques (FRET-FLIM, FCS) to investigate substrate-enzyme interactions, dimerisation of the protease, conformational dynamics of substrate, protonation of the active site, and their dependence on lipid environment. This complex approach, firmly grounded in our preliminary data, will reveal the structural principles of rhomboid IMPR mechanism, and form a methodological basis for the investigation of other IMPRs and transmembrane proteins relevant for human disease.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
10601 - Cell biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10620 - Other biological topics
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
24. 4. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
8 212 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 973 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 239 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč