Endotelové dystrofie rohovky - genetické příčiny a molekulární mechanismy
Cíle projektu
Dystrofie endotelu rohovky postihují až 4 % obyvatel nad 40 let a jsou nejčastější příčinou nutnosti transplantace této tkáně. I přes nedávné pokroky, zůstává řada pacientů bez diagnózy na molekulární úrovni. V rámci projektu se zaměříme na studium genetických faktorů a mechanismů podílejících se na vzniku endotelových dystrofií rohovky. Využijeme při tom zcela unikátní sbírku pacientských vzorků. Změny na úrovni DNA budeme zjišťovat pomocí řady metod včetně exomového a genomového sekvenování. Mechanismy budeme studovat analýzou exprese a regulace v různých buněčných modelech včetně lidského endotelu získaného od pacientů, přičemž použijeme klasické i moderní metody jako jsou např. RNA-seq, qPCR, EMSA, Western blot a imunocytochemii. Detailní klinický popis v korelaci s genotypem napomůže interpretaci funkčních dat a povede k upřesnění klasifikace endotelových dystrofií rohovky. Přímé výstupy projektu pro postižené jedince a jejich rodiny budou spočívat ve zlepšení klinického poradenství a péče. Získané poznatky umožní vývoj nových terapeutických přístupů.
Klíčová slova
corneal endotheliumposterior corneal dystropiesnovel disease-causing genesmutation
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-19278S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Corneal endothelial dystrophies - genetic causes and molecular mechanisms
Anotace anglicky
Corneal endothelial dystrophies affect up to 4% of the population over 40 years of age and represent the most common indication for corneal grafting. Despite recent advances a number of patients still lacks molecular diagnosis. We aim to investigate the genetic causes and mechanisms implicated in corneal endothelial dystrophies using a unique collection of patient samples. Changes at DNA level will be determined using different methods including genome sequencing. Mechanisms will be unravelled by studying expression and regulation of the genes of interest in various cell models including primary patient-derived corneal endothelial cell lines. We will apply a diverse range of approaches including RNA-seq. Extensive clinical data will enhance our interpretation of functional data and enable specific genotype-phenotype correlations. Importantly the project will also have direct impact on the affected individuals and families through improvement of counseling and clinical management. In the long term the knowledge gained will be used for the development of targeted therapies.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
30. 6. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
9 766 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 766 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
9 766 tis. Kč
Statní podpora
9 766 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Doba řešení
01. 01. 2020 - 30. 06. 2023