Vizualizace proteinových struktur
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
201/07/0927
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Visualization of protein structures
Anotace anglicky
Project is focused on research of the methods for visualization of proteins. Space relations in protein structures would be analysed using the computational geometry methods. Then we will search for the tunnels, which influence the reactive properties ofthe protein. To analyze large proteins, 3D Voronoi diagrams are used. We will solve the identification of the most important tunnels and their development during a time interval. Project also investigates new visualization methods build by the means of virtual reality that would make the details of the analyst process of the protein more apparent. Due to the complexity of the protein structure the importance-driven visualization would be developed.The other part of the project is focused on interactivemodification of a protein structure in the selected parts of a tunnel, using an exchange of residues and their rotamers. Here will be also applied the computational geometry methods together with combinatorial approaches. It will be also neccessary to
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
IN - Informatika
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
JC - Počítačový hardware a software
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20206 - Computer hardware and architecture
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Interdisciplinární projekt dosáhl významných výsledků. Kromě publikací na konferencích a v časopisech vznikl sw nástroj, který má dle závěrečné zprávy již 2000 registrovaných uživatelů.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2007
Ukončení řešení
31. 12. 2009
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
22. 4. 2009
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Datum dodání záznamu
22. 1. 2015
Finance
Celkové uznané náklady
1 683 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 683 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč