Strukturní dynamika, molekulové interakce a funkce klíčových motivů RNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

203-09-1476

Název projektu anglicky

Structural dynamics, molecular interactions and function of key RNA motifs

Anotace anglicky

Study of the basic principles how molecular interactions influence folding and function of large RNAs, such as the ribosome. The research will be conducted using state of the art computational (explicit solvent simulations and quantum chemistry) and bioinformatics methods, in a close cooperation with experimental laboratories. It aims primarily at analysis of energies of molecular interactions and description of stochastic flexibilities of basic RNA building blocks. Both features are crucial for function of RNAs but are very difficult to assess by experiments. The research will mainly be directed to key medium-sized autonomous RNA building blocks, with the aim to rationalize covariation principles in RNA sequences, explain lack of certain isosteric substitutions during evolution, analyze motif swaps in homologous RNAs, classify RNA base stacking patterns with inclusion of the stacking energies, catalogue structural dynamics of RNA motifs and improve 2D predictions of internal RNA loops.  

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Dle hlavního cíle projektu, řešitelský tým významně přispěl k prohloubení znalostí o RNA, fyzikální chemii molekulových interakcí modulárních částí RNA i o způsobech začlenění RNA do větších celků.Projekt byl vyřešen na vynikající úrovni. Dokladem je i ?

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 812 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 812 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč