Topologická analýza 3D organizace genomu v interfázovém jádře

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Nuclear topology of cell genome

Anotace anglicky

The aim of the project proposal is to prove the existence of topological patterns of 3D genome organization in the interphase nuclei of human and mouse fibroplasts. By means of 3D FISH and 3D ZOO-FISH with human and mouse centromere and chromosomespecifi"painting" probes, 3D confocal microscopy, and methods of mathematical analysis of the spatial distribution of point and 3D stochastic processes, the nuclear topology of a sample of orthologous chromosomal segments of human and mouse genome will be analyzed in the nuclei of human and mouse fibroplasts, aiming to prove the hypothesis on non random 3D organization of chromosomes in the interphase nucleus as a manifestationof the evolutionary conserved algorithm of 3D genome organization in the interphasenucleus. Beside the basic relevance for the fundamental research, the understanding of principles of 3D nuclear organization of chromosomes is inevitable for understanding the formation of tumour-specific translocations and chromosomal

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt si klade za cíl prokázat nenáhodné 3D uspořádání genomu v interfázovém jádře v lidských a myších buňkách, s využitím experimentálních přístupů (FISH, kontakt. mikroskopie) i matematických metod analýzy. Pomocí anti-aktinové protilátky byl prokáz

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

Datum dodání záznamu

19. 5. 2008

Celkové uznané náklady

4 729 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 309 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

3 630 tis. Kč