Fyzické mapování a funkční analýzy oblastí bohatých na geny krátkého ramene chromozómu 1 žita (1RS)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Physical mapping and functional analysis of gene-rich regions of the short arm of rye chromosome 1 (1RS)

Anotace anglicky

In more than three hundred cultivars of wheat, the short arm of rye chromosome 1R replaced the short arm of chromosome 1B. The translocation confers resistance to wheat against several diseases and insects. In addition, the 1RS chromosome arm improves adaptation and increases yield of wheat. Genes controlling these characters have not been isolated until now. However, based on latest results, they should be localized predominately in gene-rich regions, which represent only a small part of 1RS. This project aims at identification of gene-rich regions on 1RS, preparation of contigs spanning these regions and their physical localization. After sequencing selected 1RS-specific cDNAs and unique sequences, putative genes will be identified; cDNAs from different tissues will facilitate identification of tissue-specific genes. An important outcome of the project will be the creation of unique materials. In long-term, these will facilitate isolation of all genes on 1RS, preparation of its physical map

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V průběhu řešení projektu byla připravena BAC knihovna specifická pro krátké rameno chromozómu 1R. Jedná se o vůbec první chromozómově specifickou BAC knihovnu žita a tento výsledek znamená zásadní průlom při přípravě materiálů pro genomiku této plodiny.

Zahájení řešení

1. 1. 2004

Ukončení řešení

1. 1. 2006

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP07-GA0-GA-U/03:2

Datum dodání záznamu

16. 10. 2007

Celkové uznané náklady

5 035 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 255 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

2 670 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč