Interakce hPrp8:RNA při Retinitis pigmentosa – nový model nemoci pro studium příčin a následků sestřihových chyb při neurodegenetativních onemocněních

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 13 (SGA0201800003)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-01911J

Název projektu anglicky

Prp8:RNA interactions in Retinitis pigmentosa - novel disease models to study cause and consequence of splicing errors in neurodegenerative diseases

Anotace anglicky

The PRPF8 protein is a highly conserved pre-mRNA splicing factor and a component of the U5 small ribonucleoprotein particle (U5 snRNP), which functions at the catalytic center of the spliceosome. Mutations in human PRPF8 cause autosomal dominant retinal disorder called retinitis pigmentosa (RP). The most prominent pathology of RP is a loss of photoreceptor cells, degenerative changes in retinal pigment epithelium (RPE) and dysfunction in phagocytosis. We showed that RP-linked Y2334N mutation cause missplicing of specific transcripts without affecting tri-snRNP formation suggesting that the interaction with the corresponding pre-mRNA might be impaired. Using CRISPR/Cas9 editing tool we will edit PRPF8 in RPE cells to express GFP-tagged PRPF8 with the RP mutation Y2334N from its endogenous locus. We will employ advanced molecular biology techniques iCLIP and RNA-Seq to identify transcripts that are affected by RP mutation and investigate their molecular features in a suitable cellular context. Finally we will perform functional validation of target genes revealed by iCLIP.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10601 - Cell biology

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

24. 4. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GC-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2022

Celkové uznané náklady

6 487 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 241 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

246 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč