Genomová variabilita treponem během experimentální infekce

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-29596P

Název projektu anglicky

Treponemal genome variability during experimental infection

Anotace anglicky

Uncultivable treponemes are obligate pathogens of humans and animals characterized by different pathogenicity and host specificity. In pathogenic treponemes, characterized also by high immuno-evasiveness, the genetic variability within a single treponemal strain can be related to the ability to elude the immune system of the host. Identification of variable sites within a single treponemal strain may lead to better understanding of mechanisms of pathogenesis of treponemal diseases. In treponemes, subtle genetic changes are expected to determine differences in pathogenicity and host specificity. In this study we will determine variable regions within individual genomes of selected treponemal strains based on analysis of available sequencing data, characterize intra-strain variability of syphilis-causing strain DAL-1 during experimental infection of rabbits, and identify genetic variability in treponemal DNA isolated from human clinical samples.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla charakterizována heterogenita patogena Treponema pallidum na genomové a proteomové úrovni. Byly analyzovány genomy vybraných patogenních treponem a byla provedena fylogenetická analýza. Byla identifikována variabilní místa v genomech vybraných patogenních treponem a byla charakterizována jejich vnitrokmenová variabilita. Výstupem jsou 3 publikace a 5 posterových sdělení.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GP-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2017

Celkové uznané náklady

2 763 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 763 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč