Identifikace a analýza genů a genových defektů způsobujících vzácné neurovývojové poruchy u dětí

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202200001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU22-07-00165

Název projektu anglicky

Identification and analysis of genes and genetic defects causing rare neurodevelopmental disorders in children

Anotace anglicky

Neurodevelopmental disorders include developmental delay, intellectual disability, behavioural disorders with autism spectrum disorders etc. They are a large group of rare diseases caused by defects in thousands genes. By analysing exomes and genomes of families of affected children we will contribute to the identification of hitherto unknown causal genes, specification of mutational/phenotypic spectra of genes reported only in a small number of patients, and better characterisation of genetic mechanisms. About 70 families will be analysed using exome sequencing, and whole genome sequencing will be done in 50 families with no remarkable exome finding. Improvements in bioinformatic procedures for detection and interpretation of variants will focus on more difficult variants and their combinations (e.g. structural variants, variants with effect on mRNA splicing, recessive combinations of single nucleotide and structural variants, mosaics, inherited variants with incomplete penetrance etc.), as well as the user friendliness and automation of the procedures, which will be applied to new families and about 80 families unexplained in previous research. Individual clinical entities are rare, requiring collaboration of many institutions to collect a sufficient number of patients for phenotypic comparisons. Also needed are functional studies of genes and variants which are planned in the project using the Drosophila model and in collaborative studies using additional models. Our experience from previous research shows that even in relatively small cohorts, interesting cases can be identified able to contribute to better understanding of mechanisms of novel neurodevelopmental disorders. Findings in genes already clearly associated with a known disease are of immediate clinical benefit to the families of the patients. Improved bioinformatic procedures and the experience gained in the research setting will help in the implementation of genomic methods in routine practice.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30101 - Human genetics

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl po celou dobu řešen systematicky, v souladu se schváleným záměrem a bez zásadních odchylek. Dosáhl nadstandardních, mezinárodně relevantních výsledků, které významně rozšířily poznání genetických příčin neurovývojových poruch a jejich molekulárních mechanismů. Silnou stránkou je propojení diagnostického a výzkumného přístupu, využití a další rozvoj moderních genomických, bioinformatických, epigenetických i funkčních metod a aktivní zapojení do mezinárodních spoluprací. Projekt přinesl řadu kvalitních publikací, identifikaci nových genů a genotyp-fenotypových korelací i metodologické inovace s potenciálem rutinního klinického využití. Výsledky mají jasný a přímý přínos pro genetickou diagnostiku, poradenství i péči o pacienty a jejich rodiny. Celkově projekt nejen splnil, ale v řadě aspektů významně překročil původně stanovené cíle a představuje příklad velmi kvalitního aplikovaného výzkumu v oblasti genomické medicíny.

Zahájení řešení

1. 5. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

4. 3. 2025

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP26-MZ0-NU-U

Datum dodání záznamu

13. 7. 2026

Celkové uznané náklady

13 370 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

13 370 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč