Integrované genomické postupy pro pokročilou diagnostiku nehodgkinských lymfomů a pro určení mechanismů látkové rezistence

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202300001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU23-03-00172

Název projektu anglicky

Integrated genomics for advanced diagnostics of non-Hodgkin lymphomas and for decifering mechanisms of drug resistence

Anotace anglicky

Non-Hodgkin lymphomas (NHLs) represent the most common type of hematologic malignancies with incidence of 17 per 100.000 inhabitants. Current staging procedures in patients with newly diagnosed NHL are based on conventional immunohistochemistry and multiple tests for assessment of lymphoma cell Ig/TCR clonality and detection of selected molecular aberrations including somatic mutations, chromosomal translocations, and copy number alterations. Mantle cell lymphoma (MCL) is a rare B-NHL subtype accounting for approx. 6–7% NHL. Unlike classical MCL, patients with so called non-nodal (nnMCL) usually present as leukemic non-nodal disease with frequent leukemization, splenomegaly, and indolent clinical course, and can be observed for many years before they require therapy. In this project, we propose to implement EuroClonality NGS DNA capture (NDC) panel into routine diagnostics of patients with NHL at the Hematology Dept. of the University General Hospital Prague (approx. 200 new NHL patients per year). The panel enables detection of Ig/TCR rearrangements along with single-nucleotide variants (SNVs) of 72 relevant genes, most observed CNAs, and chromosomal translocations recurrently found in NHL patients in a single test. In second aim, we will use whole exome sequencing (WES) to analyze mutational profiles of 25 high-risk MIPI MCL patients, who did not experience relapse with a minimum follow-up of 5 years. We will compare this data set with a cohort of 25 MCL patients (already analyzed by WES), who experience lymphoma relapse with a median PFS 9 months. Finally, we will use single-cell RNA sequencing and WES to study clonal evolution of nnMCL at diagnostis, during observation, and before start of therapy. The project will facilitate the diagnostic process and improve prognostication of patients with newly diagnosed NHL, and will contribute to our better understanding of the correlation of genetic profiles with outcome in patients with MCL.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30205 - Hematology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

FD - Onkologie a hematologie

Zahájení řešení

1. 5. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NU-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2024

Celkové uznané náklady

18 226 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

18 226 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč