Analýza vzorců abnormální signalizace leukocytů u onemocnění dětského věku pomocí hmotnostní cytometrie a strojového učení.
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Veřejná soutěž
SMZ0202300001
Hlavní účastníci
Fakultní nemocnice v Motole
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NU23-07-00170
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Analysis of patterns of abnormal leukocyte signaling in childhood diseases using mass cytometry and machine learning.
Anotace anglicky
The project aims to detect abnormalities in intracellular signaling in patients with inborn errors of hematopoiesis, which manifest as a wide range of symptoms in childhood. We propose to study leukocyte responses to a battery of stimuli via measurement of surface receptors in patients with established signaling pathway abnormalities. We will subsequently employ this knowledge to classify disorders of unknown genetic etiology. The involvement of signaling pathways will be monitored at the single cell level by detecting phospho-epitopes of kinases using a unique mass cytometry method (CyTOF). The resulting >40 parameter data will be analyzed by artificial intelligence and topological data analysis methods to find complex patterns corresponding to signaling defects. These patterns will be used in targeted advanced molecular genetic studies to reveal the molecular nature of the diseases and to predict response to targeted therapies. We will develop a simplified cytometric monitoring for the effect of administered targeted therapy. Design of the study is observational, using biobanked patient samples as well as prospective ones.
Vědní obory
Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30209 - Paediatrics
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FG - Pediatrie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 5. 2023
Ukončení řešení
31. 12. 2026
Poslední stav řešení
B - Běžící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
28. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MZ0-NU-R
Datum dodání záznamu
21. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
15 597 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
15 597 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč