KLASIFIKACE VARIANT NEJASNÉHO VÝZNAMU V GENU CHEK2 A FENOTYPOVÁ CHARAKTERIZACE NÁDOROVÝCH ONEMOCNĚNÍ U NOSIČŮ PATOGENNÍCH VARIANT
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-03-00279
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Variants of unknown significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations
Anotace anglicky
The CHEK2 gene codes for a checkpoint kinase CHK2 phosphorylating various intracellular proteins in response to DNA damage. Pathogenic germ-line CHEK2 mutations confer an increased breast and other cancer risk. CHEK2 mutation analysis is currently an obligatory procedure required for diagnostics in Czech hereditary cancer patients. We have shown that the prevalence of germline CHEK2 variants exceeds 6.5% in high-risk breast/ovarian Czech cancer patients and that the majority of found alterations represent variants of unknown significance (VUS). We developed a unique cell-based approach quantifying CHK2-mediated phosphorylation of KAP1 protein in vivo that enables reliable functional classification of CHEK2 VUS. Here we aim to optimize the assay for the high throughput analysis and classify all CHEK2 VUS identified by Czech and international collaborators. This study will enable clinical characterization of individuals carrying deleterious CHEK2 mutations, increasing diagnostic utility of CHEK2 analysis, improving risk estimation, and enabling optimal follow-up and prevention set-up.
Vědní obory
Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
30204 - Oncology
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie<br>FD - Onkologie a hematologie
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Podle dodané dokumentace probíhaly práce (i čerpání finančních prostředků) v rámci schválených podmínek, v počtech vyšetřených variant CHEK2 byl původní plán dokonce významně překročen; rovněž shromážděný soubor pacientek i kontrol je velmi rozsáhlý. Výsledky grantu mohou sloužit v dalším výzkumu i v klinické praxi. Nejdůležitější výsledky získané v rozsáhlé mezinárodní spolupráci byly opublikovány v prestižním Clinical Cancer Research (časopis s IF v prvním decilu daného oboru). Čeští autoři jsou prvními i korespondujícími autory této významné mezinárodní publikace. Fakt, že 2 publikace z počátku řešení projektu byly publikovány v nakladatelství MDPI nesnižuje kvalitu výstupů grantu. Požadavek na výhradní dedikaci AZV je splněn. Řešení projektu je možno považovat za velmi úspěšné.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 5. 2019
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
19. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
18. 10. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
13 066 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
13 066 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč