Klasifikace variant nejasného významu v genu CHEK2 a fenotypová charakterizace nádorových onemocnění u nosičů patogenních variant (II)

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2024-2030

Veřejná soutěž

SMZ0202400001

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NW24-03-00092

Název projektu anglicky

Variants of uncertain significance in the CHEK2 gene: their functional classification and characterization of tumors in carriers of pathogenic mutations II

Anotace anglicky

The CHEK2 gene encodes protein kinase CHK2, which is involved in control of cellular responses to DNA damage. Germline pathogenic variants (PV) of CHEK2 represent one of the most common alterations occurring in patients tested for cancer predisposition in the Czech Republic and abroad. Studies in patients with breast cancer (ca) have shown a 2.5-fold increased risk of disease in carriers of germline CHEK2 PVs, which affect >1.3 % of all patients with this disease in the US and EU. In addition to PVs, rare variants of uncertain significance (VUS) occur in another >3 % of patients, complicating interpretation of genetic analyses and causing diagnostic uncertainty. In a previous project, we developed new experimental procedures and functionally categorized 340 of 460 VUS found in females with breast ca in the Czech Republic and abroad. Based on international collaboration involving 73,048 breast ca patients and 88,658 controls, we demonstrated that carriers of functionally defective germline CHEK2 missense variants have a comparable risk of breast ca as carriers of known PVs. In a follow-up project, we will expand the number of analyzed CHEK2 VUS including new variants identified in the Czech Republic and abroad in patients with various cancers. We will introduce innovative high-throughput functional assays focusing on other biological characteristics of CHK2 to categorize previously inconclusive VUS. We anticipate that these approaches will allow to categorize CHEK2 VUS in >95 % of carriers of alterations in this gene and to clinically classify these germline variants. These goals are necessary for quantification of the so far unclear risks associated with carriage of the germinal CHEK2 PVs for other cancers, which we will perform in Czech patients and in collaboration with international consortia. The results will improve the diagnostic use of NGS analyses of cancer predisposition and enable personalized prevention/care/treatment of PV CHEK2 gene carriers/patients.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30204 - Oncology

OECD FORD - vedlejší obor

30101 - Human genetics

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie<br>FD - Onkologie a hematologie

Zahájení řešení

1. 5. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NW-R

Datum dodání záznamu

25. 3. 2024

Celkové uznané náklady

14 636 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 636 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč