Hodnocení semenného sadu třešně ptačí s využitím mikrosatelitových markerů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F17%3AN0000060" target="_blank" >RIV/00020702:_____/17:N0000060 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vulhm.cz//sites/File/ZLV/fulltext/508.pdf" target="_blank" >http://www.vulhm.cz//sites/File/ZLV/fulltext/508.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Hodnocení semenného sadu třešně ptačí s využitím mikrosatelitových markerů

Popis výsledku v původním jazyce

Práce zjišťuje možnosti využití SSR markerů pro hodnocení klonové identity roubovanců semenného sadu třešně ptačí Prunus avium L. U 10 mikrosatelitových lokusů vykazovaly amplifikační produkty polymorfismus, byly interpretovatelné, a proto byly užity ke studiu klonové identity vybraného semenného sadu. Na základě molekulárních dat zjištěných ze souboru 91 jedinců ze semenného sadu byly získány statistické charakteristiky 10 mikrosatelitových markerů. Celkově bylo detekováno 65 rozdílných alel v 10 lokusech. Na základě provedených analýz byly stanoveny multilokusové genotypové profily jednotlivých klonů třešně ptačí v semenném sadu Čeladná. Při sledování klonové identity roubovanců semenného sadu byla deklarovaná klonová příslušnost potvrzena u 94 % roubovanců, což významně převyšuje předpokládanou 20= toleranční hodnotu pro nehomogenitu ramet s deklarovaným klonem. Ojediněle byly zjištěny klonově shodné ortety, tato skutečnost se dá vysvětlit existencí kořenové výmladnosti u třešně ptačí.

Název v anglickém jazyce

Evaluation of wild cherry seed orchard using microsatellite markers

Popis výsledku anglicky

The Simple Sequence Repeats (SSR) method of DNA analyses was used to clonal identification of trees in a model wild cherry (Prunus avium L.) seed orchard. Total genomic DNA was extracted by DNA Plant Mini Kit (QIAGEN) from buds taken from 91 sampled trees of the seed orchard. Samples were screened using selected ten polymorphic nuclear microsatellite markers. Measuring of the size of amplification products was carried out using the genetic analyser Applied Biosystems 3500. The obtained data were analysed by statistical programs CERVUS, GenAlEx 6.501 and Micro-Checker. There were detected 65 different alleles at 10 loci in the 91 wild cherry individuals from seed orchard. By applying of the 10 suitable markers to the 18 clones from model seed orchard we obtained multilocus genotypes (MLG). The obtained results illustrate the utility of the microsatellite loci for assessing spatial patterns of genetic diversity and for individual genotypes identification. Declared clone affiliation was confirmed in 94% of sampled trees. The identified genetic loci were verified as highly polymorphic and could be further used for clonal identification of wild cherry trees.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1330240" target="_blank" >QJ1330240: Metodické postupy molekulárně-genetického ověřování původu reprodukčního materiálu lesních dřevin s cílem chránit a reprodukovat genetické zdroje lesních dřevin v rámci opatření pro zachování a rozvoj agrobiodiverzity</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Zprávy lesnického výzkumu

ISSN

0322-9688

e-ISSN

1805-9872

Svazek periodika

62

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

271-278

Kód UT WoS článku

000424498000007

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85040686770