Zhodnocení semenného sadu lípy srdčité

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F19%3AN0000042" target="_blank" >RIV/00020702:_____/19:N0000042 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vulhm.cz/files/uploads/2020/01/578.pdf" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/files/uploads/2020/01/578.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Zhodnocení semenného sadu lípy srdčité

Popis výsledku v původním jazyce

Na základě molekulárních dat zjištěných ze souboru 377 jedinců ze semenného sadu byly získány statistické charakteristiky 8 mikrosatelitových markerů. Celkově bylo detekováno 79 rozdílných alel v 8 lokusech. Nejvíce polymorfní se jevil lokus Tc963, u kterého bylo identifikováno 17 rozdílných alel. Na základě provedených analýz byly stanoveny multilokusové genotypové profily (MLG) jednotlivých klonů lípy srdčité v semenném sadu Písecká Smoleč. Shoda genotypových profilů jedinců u sledovaných klonů byla při použití osmi SSR markerů potvrzena v 37 % případů. V analyzovaném souboru bylo možné 363 roubovanců přiřadit k příslušným ortetům, tedy 96,3 % ramet bylo možné přiřadit ke ortetům zastoupených v semenném sadě.

Název v anglickém jazyce

Evaluation of small-leaved lime seed orchard using microsatellite markers

Popis výsledku anglicky

The Simple Sequence Repeats (SSR) method of DNA analyses was used to clonal identification of trees in a model lime (Tillia cordata Mill.) seed orchard. Total genomic DNA was extracted by DNA Plant Mini Kit (QIAGEN) from young leaves taken from 377 sampled trees of the seed orchard. Samples were screened using selected eight polymorphic nuclear microsatellite markers. Measuring of the size of amplification products was carried out using the genetic analyser Applied Biosystems 3500. The obtained data were analysed by statistical programs CERVUS, GenAlEx 6.503. There were detected 79 different alleles at 8 loci in the 377 lime individuals from seed orchard. By applying of the 8 suitable markers to the 38 clones from model seed orchard we obtained multilocus genotypes (MLG). The obtained results illustrate the utility of the microsatellite loci for assessing spatial patterns of genetic diversity and for individual genotypes identification. 93.6 % of the sampled trees could be assigned to the clones represented in the seed orchard. The identified genetic loci were verified as highly polymorphic and could be further used for clonal identification of lime trees.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Zprávy lesnického výzkumu

ISSN

0322-9688

e-ISSN

1805-9872

Svazek periodika

64

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

217-223

Kód UT WoS článku

000505219000006

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85081929736