Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Validation of the beta-amy1 Transcription Profiling Assay and Selection of Reference Genes Suited for a RT-qPCR Assay in Developing Barley Caryopsis

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F12%3A00002211" target="_blank" >RIV/00027006:_____/12:00002211 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/25328859:_____/12:#0000654

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0041886" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0041886</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0041886" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0041886</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Validation of the beta-amy1 Transcription Profiling Assay and Selection of Reference Genes Suited for a RT-qPCR Assay in Developing Barley Caryopsis

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Reverse transcription coupled with real-time quantitative PCR (RT-qPCR) is a frequently used method for gene expression profiling. Reference genes (RGs) are commonly employed to normalize gene expression data. A limited information exist on the gene expression and profiling in developing barley caryopsis. Expression stability was assessed by measuring the cycle threshold (Ct) range and applying both the GeNorm (pair-wise comparison of geometric means) and Normfinder (model-based approach) principles forthe calculation. Here, we have identified a set of four RGs suitable for studying gene expression in the developing barley caryopsis. These encode the proteins GAPDH, HSP90, HSP70 and ubiquitin. We found a correlation between the frequency of occurrenceof a transcript in silico and its suitability as an RG. This set of RGs was tested by comparing the normalized level of beta-amylase (beta-amy1) transcript with directly measured quantities of the BMY1 gene product in the developing barl

  • Název v anglickém jazyce

    Validation of the beta-amy1 Transcription Profiling Assay and Selection of Reference Genes Suited for a RT-qPCR Assay in Developing Barley Caryopsis

  • Popis výsledku anglicky

    Reverse transcription coupled with real-time quantitative PCR (RT-qPCR) is a frequently used method for gene expression profiling. Reference genes (RGs) are commonly employed to normalize gene expression data. A limited information exist on the gene expression and profiling in developing barley caryopsis. Expression stability was assessed by measuring the cycle threshold (Ct) range and applying both the GeNorm (pair-wise comparison of geometric means) and Normfinder (model-based approach) principles forthe calculation. Here, we have identified a set of four RGs suitable for studying gene expression in the developing barley caryopsis. These encode the proteins GAPDH, HSP90, HSP70 and ubiquitin. We found a correlation between the frequency of occurrenceof a transcript in silico and its suitability as an RG. This set of RGs was tested by comparing the normalized level of beta-amylase (beta-amy1) transcript with directly measured quantities of the BMY1 gene product in the developing barl

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    GE - Šlechtění rostlin

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA521%2F07%2F1028" target="_blank" >GA521/07/1028: Analýza exprese genu kódujícího enzym beta-amylázu v zrnu ječmene ve vztahu ke strukturálnímu polymorfismu genu a kvalitativním vlastnostem zrna</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS One

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    7

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    1

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000307045600044

  • EID výsledku v databázi Scopus