Automatizované zpracování UAV snímků pro výpočty vegetačních indexů a zonálních statistik

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F22%3A10175814" target="_blank" >RIV/00027006:_____/22:10175814 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vurv.cz/vyzkum/software/" target="_blank" >https://www.vurv.cz/vyzkum/software/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Automatizované zpracování UAV snímků pro výpočty vegetačních indexů a zonálních statistik

Popis výsledku v původním jazyce

Software vznikl jako výstup projektu &quot;Využití zobrazovacích metod pro automatické fenotypování ve šlechtění na rezistenci k biotickým a abiotickým stresům u pšenice&quot;. Pracuje s rastrovými ortorektifikovanými vrstvami vrstvy, které reprezentují jednotlivá pásma multispektrálního snímku z konkrétního termínu snímání. Nad těmito vrsztvami je podle je schopen pracovat s ROI (oblastmi zájmu) která definují zóny pro další výpočty. Z těchto vrstev se již vdalším kroku počítá příslušný vegetační index VI. Výpočet probíhá automaticky na základě obecně platného algoritmu.Na výstupu je potom index ukládán ve formátu *.tiff, kde * reprezentuje kombinaci termínu a indexu (př. 20210604ndvi.tif). Vkódu jsou vtuto chvíli zadány algoritmy pro výpočet těchto VI: SR (Simple Ratio)NIR/R .NDVI (Normalized Difference Vegetation Index)(NIR -R)/(NIR + R), GNDVI (Green Normalized Difference Vegetation Index)(NIR -Green)/(NIR + Green), SAVI (Soil Adjusted Vegetation Index) (1.5*(NIR-R))/(NIR+R+0.5), EVI (Enhanced Vegetation Index)2.5*(NIR-R)/(NIR + 6*R -7.5*B + 1), MCARI (Modified Chlorophyll Absorption Ratio Index)((NIR-R)-0.2*(NIR-G))*(NIR/R), NDRE (Normalized Difference Red Edge Index) (NIR -RE)/(NIR + RE), ExG (Excess Green Index)2*g-r-b, ExR (Excess Red Index)1.4(g-b), ExG-ExRdifference of ExG and ExR. Na výstupu ke každé ROI / zóně identifikované jedinačným ID je přiřazena hodnota VI, která je počítána je počítána jako vážený průměr hodnot VI. Výsledky zonální statistiky ZS jsou ukládány do souboru *.csv. Výsledná tabulka pak obsahuje ZS pro každou zónu vjednotlivých termínech. Na jejím základě lze dále zobrazovat např. vývoj indexu během sezóny a porovnávat tento vývoj vjednotlivých částech pozemku.

Název v anglickém jazyce

Automated processing of UAV images for calculations of vegetation indices and zonal statistics

Popis výsledku anglicky

The software was created as an output of the project &quot;Use of imaging methods for automatic phenotyping in breeding for resistance to biotic and abiotic stresses in wheat&quot;. It works with raster orthorectified layer layers that represent individual bands of a multispectral image from a specific acquisition term. Above these layers, it can work with ROIs (regions of interest) that define zones for further calculations. From these layers, the appropriate vegetation index VI is calculated . The calculation takes place automatically based on a generally valid algorithm. The index is then stored on the output in *.tiff format, where * represents a combination of term and index . Algorithms for calculating these VIs are currently entered in the code: SR (Simple Ratio)NIR/R, NDVI (Normalized Difference Vegetation Index)(NIR -R)/(NIR + R), GNDVI (Green Normalized Difference Vegetation Index)(NIR - Green)/(NIR + Green), SAVI (Soil Adjusted Vegetation Index) (1.5*(NIR-R))/(NIR+R+0.5), EVI (Enhanced Vegetation Index)2.5*(NIR-R)/( NIR + 6*R -7.5*B + 1), MCARI (Modified Chlorophyll Absorption Ratio Index)((NIR-R)-0.2*(NIR-G))*(NIR/R), NDRE (Normalized Difference Red Edge Index) (NIR -RE)/(NIR + RE), ExG (Excess Green Index)2*g-r-b, ExR (Excess Red Index)1.4(g-b), ExG-ExRdifference of ExG and ExR. At the output, a VI value is assigned to each ROI / zone identified by the unit ID, which is calculated as a weighted average of the VI values. The results of ZS zonal statistics are saved in a *.csv file. The resulting table then contains ZS for each zone in individual terms. Based on it, it is possible to display, for example, the development of the index during the season and compare this development in individual parts of the plot.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910041" target="_blank" >QK1910041: Využití zobrazovacích metod pro automatické fenotypování ve šlechtění na rezistenci k biotickým a abiotickým stresům u pšenice</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

AuvegSoft

Technické parametry

https://www.vurv.cz/vyzkum/software/

Ekonomické parametry

Softwarový algoritmus

IČO vlastníka výsledku

00027006

Název vlastníka

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Drnovská 507, Praha 6, 16100