Sada pro diagnostiku variant antibakteriálních TLR genů skotu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F18%3AN0000043" target="_blank" >RIV/00027014:_____/18:N0000043 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vuzv.cz/_privat/18043.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/18043.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sada pro diagnostiku variant antibakteriálních TLR genů skotu

Popis výsledku v původním jazyce

Řešení se týká postupu pro laboratorní určování strukturních variant u pěti genů skupiny TLR, které se podílejí na rané imunitě proti bakteriálním původcům chorob skotu. Oblast techniky lze obecně označit jako veterinární DNA diagnostiku. Návrh sady reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Podkladem pro vytvoření užitného vzoru bylo bioinformatické a populačně genetické vyhodnocení variability v imunitních genech TLR skotu, jmenovitě mléčných plemene česká červinka a český strakatý skot. V druhé části vývoje byl proveden návrh a odzkoušení oligonukleotidových primerů pro genotypovací reakce. Cílem při vývoji užitného vzoru bylo vytvořit ucelenou sadu reakcí, která zahrne genetické polymorfismy s diagnostickým významem pro určení zbývajících polymorfismů, které nejsou testovány přímo. Sada tak poskytuje možnost určit všechny varianty antibakteriálních TLR genů, vyskytující se v dané populaci skotu, s minimálním počtem reakcí. Náklady i pracnost metody jsou významně sníženy souběžným prováděním genotypovacích reakcí v multiplexech 5 až 6 reakcí.

Název v anglickém jazyce

A kit for the diagnosis of bovine TLR antigen variants

Popis výsledku anglicky

The technical solution covers the procedure for the laboratory determination of the structural variants in five genes of the TLR group that participate in the early immunity against the causal agents of the bacterial diseases of cattle. The area of the method can be generally denoted as the veterinary DNA diagnostics. The design of the set of reactions is derived from the general technique of primer extension which exploits the first step in the enzymatic synthesis of the complementary strand of DNA for the determination of the type of nucleotide. The framework for the design of the procedure was the bioinformatic and population-wide estimate of the variability in the immunity genes of the TLR family in the milk breeds of the Czech Red and the Czech Red Pied cattle. In the second part of the protocol development, the design of the genotyping primers and the optimization of the genotyping reactions was performed. The reaction panel is aimed at the genetic polymorphisms with diagnostic value (the so-called tagSNPs) for the determination of the remaining polymorphisms. The presence of the latter is subsequently simply derived. In this way, the reaction set allows for the determination of all variants of the antibacterial TLR genes present in the given population with a minimum number of genotyping reactions required. The labour and financial costs of the method are significantly reduced by multiplexing 5- 6 reactions to be performed in parallel.

Druh

F_uzit - Užitný vzor

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/TG01010082" target="_blank" >TG01010082: Zefektivnění systému výzkum – vývoj – inovace - transfer v oblasti živočišné výroby pro zlepšení konkurenceschopnosti agrárního sektoru</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

31484

Vydavatel

CZ001 -

Název vydavatele

Industrial Property Office

Místo vydání

Prague

Stát vydání

CZ - Česká republika

Datum přijetí

—

Název vlastníka

Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)