Sada pro diagnostiku variant antivirového genu TLR8 skotu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F18%3AN0000044" target="_blank" >RIV/00027014:_____/18:N0000044 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vuzv.cz/_privat/18044.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/18044.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sada pro diagnostiku variant antivirového genu TLR8 skotu

Popis výsledku v původním jazyce

Řešení se týká sady reakcí pro diagnostiku variant genu TLR8 u mléčného skotu. Význam genu TLR8 je určen tím, že se podílí na rané imunitě proti virovým původcům chorob skotu. Oblast techniky lze obecně označit jako veterinární DNA diagnostiku. Sada reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Podkladem pro řešení bylo bioinformatické a populačně genetické vyhodnocení variability v imunitních genech TLR u dojeného skotu. V druhé části vývoje potom návrh oligonukleotidových primerů pro genotypovací reakce a jejich optimalizace. Ucelená sada reakcí se zaměřuje na ty genetické polymorfismy, které se vyskytují ve středoevropské populaci dojeného skotu, a dosahuje tak úspor prováděných reakcí. Sada tudíž odstraňuje nedostatky dosavadních metod pro tuto skupinu TLR a přidává hodnotu optimalizace pro danou populaci. Výběr SNP vychází ze zastoupení polymorfismů v reprezentativních plemenech česká červinka a český strakatý skot. Součástí navrženého řešení je také optimalizace podmínek pro souběžné provádění sdružených genotypovacích reakcí ve skupinách (multiplexech) 5 a 6 reakcí, což umožňuje snížit výrazně náklady i pracnost metody.

Název v anglickém jazyce

A kit for the diagnosis of bovine TLR8 antiviral gene variants

Popis výsledku anglicky

The solution covers reaction for the molecular diagnostics of the variants of TLR8 in milking cattle. The importance of the TLR8 gene is determined by its participation in the early immunity against the viral diseases of cattle. The area of the technology can be generally denoted as veterinary diagnostics. The design of the set of reactions is derived from the general technique of primer extension which exploits the first step in the enzymatic synthesis of the complementary strand of DNA for the determination of the type of nucleotide. The framework for the design of the procedure was the bioinformatic and population-wide estimate of the variability in the immunity genes of the TLR family in the milking cattle population. The second part of the protocol development included the design of the genotyping primers and the optimization of the genotyping reactions. The integral panel of reactions targets those genetic polymorphisms that are spread in the Central European population of milking cattle, achieving in this way the reduction in costs. The set eliminates the disadvantages of the former methods for the polymorphism screening in this group of TLR and adds a value of the optimization for the given population. The selection of SNP follows the distribution of the polymorphism in the representative breeds of the Czech Red and the Czech Red Pied cattle. The part of the developed solution is the optimization of the conditions for parallel realization of the multiplexed genotyping reactions in the groups of 5 and 6, which markedly decreases the labour and financial costs of the method.

Druh

F_uzit - Užitný vzor

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

31486

Vydavatel

CZ001 -

Název vydavatele

Industrial Property Office

Místo vydání

Prague

Stát vydání

CZ - Česká republika

Datum přijetí

—

Název vlastníka

Výzkumný ústav živočišné výroby, v.v.i.

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)