Sada reakcí pro diagnostiku variant genu MYD88 skotu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F19%3AN0000078" target="_blank" >RIV/00027014:_____/19:N0000078 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0032/uv032890.pdf" target="_blank" >https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0032/uv032890.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sada reakcí pro diagnostiku variant genu MYD88 skotu

Popis výsledku v původním jazyce

Řešení se vztahuje k postupu pro laboratorní určování strukturních variant genu MYD88 u skotu. Gene MYD88 kóduje myeloidní diferenciační faktor 88 (MyD88), klíčovou složku systému přirozené imunity, která působí na začátku Toll signální dráhy od receptorů přirozené imunity ze skupiny Toll-like receptorů. Proto mohou přirozeně se vyskytující varianty genu MYD88 ovlivnit účinnost rozpoznávání patogenů a kinetiku imunitní odpovědi. V rámci užitného vzoru byla vyřešena strukturní obtížnost tohoto genu pro PCR amplifikaci, proběhl návrh reakcí a optimalizace skupin (multiplexů), v nichž jsou reakce prováděny souběžně po 5 až 7 pro snížení pracnosti a nákladů. Návrh sady reakcí vychází z obecné metody extenze primeru, která využívá pro určení typu záměny nukleotidu v DNA první krok v enzymatické syntéze komplementárního vlákna DNA. Řešení rovněž vycházelo ze zjištěného zastoupení jednotlivých genových variant ve středoevropské populaci mléčného skotu, jmenovitě u plemene český strakatý skot. Sada tak poskytuje možnost určit u jednotlivých zvířat většinu variant genu MYD88 vyskytujících se v dané populaci skotu, a to v minimálním počtu samostatných reakčních objemů. Sada reakcí také zahrnuje polymorfismy s diagnostickým významem pro předpověď dodatečných polymorfismů ve skupinách s genetickou vazbou, tzv. haplotypech.

Název v anglickém jazyce

Kit for diagnosing bovine MYD88 gene variants

Popis výsledku anglicky

The technical solution covers the procedure for the laboratory determination of the structural variants in gene MYD88 of cattle. Gene MYD88 codes for the myeloid differentiation factor 88 (MyD88), a key component of the innate immunity system. It acts at the beginning of the Toll signalling pathway from the group of Toll-like receptors. That is why some naturally occurring variants of the MYD88 gene can affect the efficiency of pathogen recognition and the kinetics of immune response. In frame of the utility model, the structural constraints on the PCR amplification of this gene have been overcome, the reaction design has been realized and the optimization of groups (multiplexes) in which the reactions are carried out by 5 – 7 in parallel has been carried out in order to reduce labouriousness and costs. The design of the reaction set is based on the general method of primer extension, which uses the first step of the enzymatic synthesis of the complementary DNA strand. The solution also included the found representation of individual gene variants in the central European population of dairy cattle, namely, in the Simmental-type breed Czech Red Pied. The set thus provides the possibility to determine most of the variants of gene MYD88 present in the given population in individual animals, using a minimum number of separate reaction volumes. The set of reactions also includes polymorphisms with diagnostic value for the prediction of additional polymorphisms in the groups based on genetic linkage, the so-called haplotypes.

Druh

F_uzit - Užitný vzor

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1610489" target="_blank" >QJ1610489: Výskyt genetických faktorů pro infekční odolnost u vybraných plemen mléčného skotu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

32890

Vydavatel

CZ001 -

Název vydavatele

Industrial Property Office

Místo vydání

Prague

Stát vydání

CZ - Česká republika

Datum přijetí

—

Název vlastníka

VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, v.v.i. V UHŘÍNĚVSI

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)