Whole-genome sequence of a reassortant G9P [4] rotavirus A strain from two children in the Czech Republic

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F20%3AN0000010" target="_blank" >RIV/00027162:_____/20:N0000010 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989592:15110/20:73605717
Výsledek na webu
<a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00705-020-04648-w" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007/s00705-020-04648-w</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-020-04648-w" target="_blank" >10.1007/s00705-020-04648-w</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Whole-genome sequence of a reassortant G9P [4] rotavirus A strain from two children in the Czech Republic
Popis výsledku v původním jazyce
An unusual reassortant rotavirus A (RVA) strain was isolated during RVA surveillance in two previously hospitalized children in 2018. G/P typing revealed uncommon G9P[4] genotypes, so the strains were further characterized by Illumina next-generation sequencing. Whole-genome typing showed that the two strains had a DS-1-like backbone except for NSP2: G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2. The two strains shared 99.9-100% nucleotide sequence identity in all genes.
Název v anglickém jazyce
Whole-genome sequence of a reassortant G9P [4] rotavirus A strain from two children in the Czech Republic
Popis výsledku anglicky
An unusual reassortant rotavirus A (RVA) strain was isolated during RVA surveillance in two previously hospitalized children in 2018. G/P typing revealed uncommon G9P[4] genotypes, so the strains were further characterized by Illumina next-generation sequencing. Whole-genome typing showed that the two strains had a DS-1-like backbone except for NSP2: G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2. The two strains shared 99.9-100% nucleotide sequence identity in all genes.

Projekt
<a href="/cs/project/NV16-29937A" target="_blank" >NV16-29937A: Komplexní analýza humánních rotavirových infekcí v České republice včetně atypických a emergentních kmenů směřující k vývoji nových detekčních metod</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Podobné výsledky(10)