Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Identification of novel informative loci for DNA-based X-inactivation analysis

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F15%3A10294666" target="_blank" >RIV/00216208:11110/15:10294666 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00064165:_____/15:10294666

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.bcmd.2014.10.001" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.bcmd.2014.10.001</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.bcmd.2014.10.001" target="_blank" >10.1016/j.bcmd.2014.10.001</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Identification of novel informative loci for DNA-based X-inactivation analysis

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The HUMARA assay, the most common method for evaluation of X-inactivation skewing in blood cells, has been reported to be usable in only about 80% of females, emphasizing the need for alternative methods for testing of HUMARA-uninformative individuals. We conducted an in silico search for potentially polymorphic tri-to-hexanucleotide repeats in the proximity of CpG islands located in 5' regions of X-chromosome genes to design five candidate assays (numbered I, II, III, IV, and V) combining methylation-specific restriction digest with PCR amplification in a manner similar to the HUMARA assay. The results obtained by these assays in 100 healthy females were compared to X-inactivation skewing measured by the AR-MSP method which is based on methylation-specific PCR amplification of the first exon of the AR gene. On the basis of statistical evidence, three of the novel assays (II, IV, and V), which were informative in 18%, 61%, and 55% of females in the cohort, respectively, may be used as

  • Název v anglickém jazyce

    Identification of novel informative loci for DNA-based X-inactivation analysis

  • Popis výsledku anglicky

    The HUMARA assay, the most common method for evaluation of X-inactivation skewing in blood cells, has been reported to be usable in only about 80% of females, emphasizing the need for alternative methods for testing of HUMARA-uninformative individuals. We conducted an in silico search for potentially polymorphic tri-to-hexanucleotide repeats in the proximity of CpG islands located in 5' regions of X-chromosome genes to design five candidate assays (numbered I, II, III, IV, and V) combining methylation-specific restriction digest with PCR amplification in a manner similar to the HUMARA assay. The results obtained by these assays in 100 healthy females were compared to X-inactivation skewing measured by the AR-MSP method which is based on methylation-specific PCR amplification of the first exon of the AR gene. On the basis of statistical evidence, three of the novel assays (II, IV, and V), which were informative in 18%, 61%, and 55% of females in the cohort, respectively, may be used as

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    FD - Onkologie a hematologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/NT14015" target="_blank" >NT14015: Rozvoj metod laboratorní diagnostiky dědičných lysosomálních neurodegenerativních poruch</a><br>

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Blood Cells, Molecules, and Diseases

  • ISSN

    1079-9796

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    54

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    210-216

  • Kód UT WoS článku

    000348250300014

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84922580269