Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Molecular dynamics comparison of E. coli WrbA apoprotein and holoprotein

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F14%3A10288320" target="_blank" >RIV/00216208:11310/14:10288320 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/67179843:_____/14:00437116 RIV/61388971:_____/14:00437116 RIV/60076658:12310/14:43887251

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00894-014-2400-8" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s00894-014-2400-8</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00894-014-2400-8" target="_blank" >10.1007/s00894-014-2400-8</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Molecular dynamics comparison of E. coli WrbA apoprotein and holoprotein

  • Popis výsledku v původním jazyce

    WrbA is a novel multimeric flavodoxin-like protein of unknown function. A recent high-resolution X-ray crystal structure of E. coli WrbA holoprotein revealed a methionine sulfoxide residue with full occupancy in the FMN-binding site, a finding that was confirmed by mass spectrometry. In an effort to evaluate whether methionine sulfoxide may have a role in WrbA function, the present analyses were undertaken using molecular dynamics simulations in combination with further mass spectrometry of the protein.Methionine sulfoxide formation upon reconstitution of purified apoWrbA with oxidized FMN is fast as judged by kinetic mass spectrometry, being complete in similar to 5 h and resulting in complete conversion at the active-site methionine with minor extents of conversion at heterogeneous second sites. Analysis of methionine oxidation states during purification of holoWrbA from bacterial cells reveals that methionine is not oxidized prior to reconstitution, indicating that methionine sulfo

  • Název v anglickém jazyce

    Molecular dynamics comparison of E. coli WrbA apoprotein and holoprotein

  • Popis výsledku anglicky

    WrbA is a novel multimeric flavodoxin-like protein of unknown function. A recent high-resolution X-ray crystal structure of E. coli WrbA holoprotein revealed a methionine sulfoxide residue with full occupancy in the FMN-binding site, a finding that was confirmed by mass spectrometry. In an effort to evaluate whether methionine sulfoxide may have a role in WrbA function, the present analyses were undertaken using molecular dynamics simulations in combination with further mass spectrometry of the protein.Methionine sulfoxide formation upon reconstitution of purified apoWrbA with oxidized FMN is fast as judged by kinetic mass spectrometry, being complete in similar to 5 h and resulting in complete conversion at the active-site methionine with minor extents of conversion at heterogeneous second sites. Analysis of methionine oxidation states during purification of holoWrbA from bacterial cells reveals that methionine is not oxidized prior to reconstitution, indicating that methionine sulfo

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EH - Ekologie – společenstva

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GAP207%2F10%2F1934" target="_blank" >GAP207/10/1934: Strukturní pohled na funkci proteinu WrbA – zakládající člen rodiny proteinů zahrnutých v buněčné obraně proti oxidativnímu stresu.</a><br>

  • Návaznosti

    S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Molecular Modeling

  • ISSN

    1610-2940

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    20

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    14

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000341865300006

  • EID výsledku v databázi Scopus