Protein Sequences Identification using NM-tree

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F11%3A10099582" target="_blank" >RIV/00216208:11320/11:10099582 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dl.acm.org/citation.cfm?id=1995440" target="_blank" >http://dl.acm.org/citation.cfm?id=1995440</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1145/1995412.1995440" target="_blank" >10.1145/1995412.1995440</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Protein Sequences Identification using NM-tree
Popis výsledku v původním jazyce
We have generalized a method for tandem mass spectra interpretation, based on the parameterized Hausdorff distance. Instead of just peptides (short pieces of proteins), in this paper we describe the interpretation of whole protein sequences. For this purpose, we employ the recently introduced NM-tree to index the database of hypothetical mass spectra for exact or fast approximate search. The NM-tree combines the M-tree with the TriGen algorithm in a way that allows to dynamically control the retrieval precision at query time. A scheme for protein sequences identification using the NM-tree is proposed.
Název v anglickém jazyce
Protein Sequences Identification using NM-tree
Popis výsledku anglicky
We have generalized a method for tandem mass spectra interpretation, based on the parameterized Hausdorff distance. Instead of just peptides (short pieces of proteins), in this paper we describe the interpretation of whole protein sequences. For this purpose, we employ the recently introduced NM-tree to index the database of hypothetical mass spectra for exact or fast approximate search. The NM-tree combines the M-tree with the TriGen algorithm in a way that allows to dynamically control the retrieval precision at query time. A scheme for protein sequences identification using the NM-tree is proposed.

Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku
Fourth International Conference on Similarity Search and Applications 2011
ISBN
978-1-4503-0795-6
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
2
Strana od-do
125-126
Název nakladatele
ACM
Místo vydání
New York, USA
Místo konání akce
Lipari, Italy
Datum konání akce
30. 6. 2011
Typ akce podle státní příslušnosti
EUR - Evropská akce
Kód UT WoS článku
—

Podobné výsledky(10)