Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F12%3A00081800" target="_blank" >RIV/00216224:14110/12:00081800 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001471" target="_blank" >http://www.plosntds.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pntd.0001471</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001471" target="_blank" >10.1371/journal.pntd.0001471</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Spirochete Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) is the causative agent of yaws while strains of Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) cause syphilis. Both yaws and syphilis are distinguished on the basis of epidemiological characteristics and clinicalsymptoms. Neither treponeme can reproduce outside the host organism, which precludes the use of standard molecular biology techniques used to study cultivable pathogens. In this study, we determined high quality whole genome sequences of TPE strains andcompared them to known genetic information for T. pallidum ssp. pallidum strains. The genome structure was identical in all three TPE strains and also between TPA and TPE strains. The TPE genome length ranged between 1,139,330 bp and 1,139,744 bp. The overall sequence identity between TPA and TPE genomes was 99.8%, indicating that the two pathogens are extremely closely related. A set of 34 TPE genes (3.5%) encoded proteins containing six or more amino acid replacements or other major s

  • Název v anglickém jazyce

    Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence

  • Popis výsledku anglicky

    Spirochete Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) is the causative agent of yaws while strains of Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) cause syphilis. Both yaws and syphilis are distinguished on the basis of epidemiological characteristics and clinicalsymptoms. Neither treponeme can reproduce outside the host organism, which precludes the use of standard molecular biology techniques used to study cultivable pathogens. In this study, we determined high quality whole genome sequences of TPE strains andcompared them to known genetic information for T. pallidum ssp. pallidum strains. The genome structure was identical in all three TPE strains and also between TPA and TPE strains. The TPE genome length ranged between 1,139,330 bp and 1,139,744 bp. The overall sequence identity between TPA and TPE genomes was 99.8%, indicating that the two pathogens are extremely closely related. A set of 34 TPE genes (3.5%) encoded proteins containing six or more amino acid replacements or other major s

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA310%2F07%2F0321" target="_blank" >GA310/07/0321: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS Neglected Tropical Diseases

  • ISSN

    1935-2727

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    14

  • Strana od-do

    "nestrankovano"

  • Kód UT WoS článku

    000300416100021

  • EID výsledku v databázi Scopus