Metody výpočtu více tunelů v molekulách proteinů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F08%3A00024968" target="_blank" >RIV/00216224:14330/08:00024968 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Computation of more channels in protein molecules

Popis výsledku v původním jazyce

In the process of designing drugs it is crucial to perform various analyses of cavities and channels in protein molecules. Chemists also require that more than one ideal channel be computed in a static protein molecule. Three basic approaches for computation of more than a single channel were introduced in recent publications. However, these approaches have several disadvantages. In this paper we propose a new adaptive method for computation of more channels. This new method is piloted on a real data and results are compared with channels identified by chemists as relevant. The comparison indicates that this method is a significant improvement over previous methods, as the method computes less number of similar and biochemically insignificant channels.

Název v anglickém jazyce

Computation of more channels in protein molecules

Popis výsledku anglicky

In the process of designing drugs it is crucial to perform various analyses of cavities and channels in protein molecules. Chemists also require that more than one ideal channel be computed in a static protein molecule. Three basic approaches for computation of more than a single channel were introduced in recent publications. However, these approaches have several disadvantages. In this paper we propose a new adaptive method for computation of more channels. This new method is piloted on a real data and results are compared with channels identified by chemists as relevant. The comparison indicates that this method is a significant improvement over previous methods, as the method computes less number of similar and biochemically insignificant channels.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Computation of more channels in protein molecules

ISBN

978-3-905674-13-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

—

Název nakladatele

Eurographics Association

Místo vydání

Aire-la-Ville, Switzerland

Místo konání akce

Delft, Netherlands

Datum konání akce

6. 10. 2008

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—