Tracking single channel in protein dynamics

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F10%3A00043248" target="_blank" >RIV/00216224:14330/10:00043248 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Tracking single channel in protein dynamics

Popis výsledku v původním jazyce

In this paper we present a new approach to the processing of molecule dynamics. The method performs the tracking of a channel in a sequence of molecule snapshots which represent atom positions in the molecule in certain time intervals. The centerline ofthe tracked channel is refined using the Delaunay triangulation from the actual snapshot resulting in a new optimized centerline. This method allows us easily to animate the behaviour of the channel in the sequence. The method can also be used to detectthe channel geometry in snapshots, where recent methods are not able to find this channel. In addition, the method yields information about channel parameters which vary over time. We can evaluate opening and closing of the input channel.

Název v anglickém jazyce

Tracking single channel in protein dynamics

Popis výsledku anglicky

In this paper we present a new approach to the processing of molecule dynamics. The method performs the tracking of a channel in a sequence of molecule snapshots which represent atom positions in the molecule in certain time intervals. The centerline ofthe tracked channel is refined using the Delaunay triangulation from the actual snapshot resulting in a new optimized centerline. This method allows us easily to animate the behaviour of the channel in the sequence. The method can also be used to detectthe channel geometry in snapshots, where recent methods are not able to find this channel. In addition, the method yields information about channel parameters which vary over time. We can evaluate opening and closing of the input channel.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

WSCG Communication Papers proceedings

ISBN

978-80-86943-87-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

—

Název nakladatele

University of West Bohemia

Místo vydání

Plzeň

Místo konání akce

Plzeň

Datum konání akce

1. 1. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—