Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F17%3A00094899" target="_blank" >RIV/00216224:14330/17:00094899 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-67471-1_3" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-67471-1_3</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-67471-1_3" target="_blank" >10.1007/978-3-319-67471-1_3</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters

Popis výsledku v původním jazyce

Complex behaviour arising in biological systems is typically characterised by various kinds of attractors. An important problem in this area is to determine these attractors. Biological systems are usually described by highly parametrised dynamical models that can be represented as parametrised graphs typically constructed as discrete abstractions of continuous-time models. In such models, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we introduce a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs. The method is supplied with a parallel algorithm and evaluated on discrete abstractions of several non-linear biological models.

Název v anglickém jazyce

Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters

Popis výsledku anglicky

Complex behaviour arising in biological systems is typically characterised by various kinds of attractors. An important problem in this area is to determine these attractors. Biological systems are usually described by highly parametrised dynamical models that can be represented as parametrised graphs typically constructed as discrete abstractions of continuous-time models. In such models, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we introduce a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs. The method is supplied with a parallel algorithm and evaluated on discrete abstractions of several non-linear biological models.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Computational Methods in Systems Biology. CMSB 2017

ISBN

9783319674704

ISSN

0302-9743

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

17

Strana od-do

40-56

Název nakladatele

Springer International Publishing

Místo vydání

Cham

Místo konání akce

Darmstadt, Germany

Datum konání akce

27. 9. 2017

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—