Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models

Kód výsledku v IS VaVaI

RIV/86652079:_____/18:00497427 - isvavai.cz

Výsledek na webu

https://ieeexplore.ieee.org/xpl/mostRecentIssue.jsp?punumber=8514498

DOI - Digital Object Identifier

10.1109/ICSTCC.2018.8540762

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models

Popis výsledku v původním jazyce

Complex dynamics arising in biological systems can be characterised by various kinds of attractors. To that end, the task of determining attractors becomes important in modern systems analysis. Biological systems are typically formalised as highly parametrised continuous-time ODE models. Such models can be abstracted in the form of parametrised graphs. In such abstractions, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we demonstrate a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs on several models of cyanobacteria taken from the domain-specific online platform e-cyanobacterium.org.

Název v anglickém jazyce

Fully Automated Attractor Analysis of Cyanobacteria Models

Popis výsledku anglicky

Complex dynamics arising in biological systems can be characterised by various kinds of attractors. To that end, the task of determining attractors becomes important in modern systems analysis. Biological systems are typically formalised as highly parametrised continuous-time ODE models. Such models can be abstracted in the form of parametrised graphs. In such abstractions, attractors are observed in the form of terminal strongly connected components (tSCCs). In this paper, we demonstrate a novel method for detecting tSCCs in parametrised graphs on several models of cyanobacteria taken from the domain-specific online platform e-cyanobacterium.org.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

LM2015055: Centrum pro systémovou biologii

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

22nd International Conference on System Theory, Control and Computing (ICSTCC)

ISBN

—

ISSN

2372-1618

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

354-359

Název nakladatele

IEE

Místo vydání

Sinaia

Místo konání akce

Sinaia

Datum konání akce

10. 12. 2018

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—