Monitoring of biogenic amines produced by E.coli strains in raw milk and cheese
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26788462%3A_____%2F10%3A%230000374" target="_blank" >RIV/26788462:_____/10:#0000374 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
slovinština
Název v původním jazyce
Monitoring biogénnych amínov produkovaných kmeňmi E. coli v surovom mlieku a syroch
Popis výsledku v původním jazyce
Cieľom prezentovanej práce bolo vyhodnotiť prítomnosť génov pre ornitín (speC), histidín (hdc), lysín (cadA) a glutamát dekarboxylázu (gadA/B) v patogénnych kmeňoch E.coli pomocou novo zavedených a publikovaných testov PCR. Testovaním sme získali prostriedok na identifikáciu prítomnosti jednotlivých biogénnych amínov: putrescínu, histamínu, kadaverínu a gamma-aminobutyrovej kyseliny (GABA) v gram negatívnych baktériách. Na porovnanie referenčných sekvencií a analýzu konzervovaných domén v skúmaných génoch boli použité programy ClustalW a BLAST, primery boli designované pomocou programu Primer3. Predmetom analýzy bolo celkovo 26 kmeňov E. coli izolovaných zo surového kravského, ovčieho a kozieho mlieka a syra, vzorky boli získané zo šiestich fariem a odsiedmich potravinových výrobcov. 81 % kmeňov disponovalo génom speC, 96 % génom gadA/B, 23 % vzoriek bolo pozitívnych na PCR test pre gén hdc a 54 % na test pre gén cadA.
Název v anglickém jazyce
Monitoring of biogenic amines produced by E.coli strains in raw milk and cheese
Popis výsledku anglicky
In this study, the presence of ornithine (speC), histidine (hdc), lysine (cadA) and glutamate decarboxylase (gadA/B) genes were investigated in pathogenic E. coli strains using newly established and published PCR methods. The aim was to find a high-throughput tool for identifying the presence of related biogenic amines: putrescine, histamine, cadaverine and gamma-aminobutyric acid (GABA) in gram negative bacteria. The alignment of the multiple sequences and analysis of conserved sequences in the studiedgenes was carried out using ClustalW and BLAST programs, the primers were designed with the Primer3 software. 26 E. coli strains isolated from raw cow, sheep and goat bulk milk samples and cheeses obtained from 6 farms and 7 companies were evaluated. 81% strains were positive for speC gene presence, 96 % for gadA/B PCR test, 23 % samples were positive for hdc and 54 % for cadA PCR test.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Výzkum v chovu skotu
ISSN
0139-7265
e-ISSN
—
Svazek periodika
52
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—