Parallel algorithms for mapping short degenerate and weighted DNA sequences to a reference genome
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F12%3A43915986" target="_blank" >RIV/49777513:23520/12:43915986 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1142/S0129054112400114" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1142/S0129054112400114</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1142/S0129054112400114" target="_blank" >10.1142/S0129054112400114</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Parallel algorithms for mapping short degenerate and weighted DNA sequences to a reference genome
Popis výsledku v původním jazyce
One of the most ambitious trends in current biomedical research is the large-scale genomic sequencing of patients' DNA. Novel high-throughput (or next-generation) sequencing technologies have redefined the way genome sequencing is performed. They are able to produce millions of short sequences (reads) in a single experiment, and with a much lower cost than previously possible. Due to this massive amount of data, efficient algorithms for mapping these sequences to a reference genome are in great demand.In this paper, we design parallel algorithms, to address this problem efficiently.
Název v anglickém jazyce
Parallel algorithms for mapping short degenerate and weighted DNA sequences to a reference genome
Popis výsledku anglicky
One of the most ambitious trends in current biomedical research is the large-scale genomic sequencing of patients' DNA. Novel high-throughput (or next-generation) sequencing technologies have redefined the way genome sequencing is performed. They are able to produce millions of short sequences (reads) in a single experiment, and with a much lower cost than previously possible. Due to this massive amount of data, efficient algorithms for mapping these sequences to a reference genome are in great demand.In this paper, we design parallel algorithms, to address this problem efficiently.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
IN - Informatika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
INTERNATIONAL JOURNAL OF FOUNDATIONS OF COMPUTER SCIENCE
ISSN
0129-0541
e-ISSN
—
Svazek periodika
23
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
CN - Čínská lidová republika
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
249-259
Kód UT WoS článku
000302061000003
EID výsledku v databázi Scopus
—