Identifikace treskovitých ryb metodou PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F06%3A00000794" target="_blank" >RIV/62157124:16270/06:00000794 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00027162:_____/06:#0000026

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Identifikace treskovitých ryb metodou PCR

Popis výsledku v původním jazyce

V této práci byla rozvíjena konvenční PCR metoda, která umožňuje rozdělení druhů treskovitých ryb. Identifikace druhů ryb je důležitá zvláště k odhalení falšovaných importovaných rybích produktů. Dosud jsme schopni rozlišit DNA typickou pro tresku aljašskou a tresku obecnou podle velikosti PCR produktů. Základní stanovení pro určení druhu tresky byly založeny na částečné Pan I genové sekvenci. V současnosti byl uskutečněn screening vzorků tresky od různých výrobců a distributorů. Bylo opatřeno 59 vzorkůzmrazených tresčích filetů a kompaktních masových bloků, které jsou k dostání v českých obchodech. Nyní, 38 vzorků bylo vyšetřeno. Z tohoto počtu, 24 DNA vzorků bylo zesíleno použitím určitých základů pro štikozubce. Jen 3 vzorky byly potvrzeny jako treska aljašská. Žádná treska obecná nebyla identifikována. 5 rybích DNA vzorků bylo zesíleno současně základy pro štikozubce a pro tresku aljašskou. Vzorky jsou jako mix obou druhů. Žádné PCR produkty nebyly získány u 6 vzorků. Metody uvede

Název v anglickém jazyce

Identification of codfish species by PCR method

Popis výsledku anglicky

In this study, coventional PCR method enabling differentiation of codfish species has been developed. Fish species identification is important especially to reveal imported fish products adulteration. Up to now we are able to differentiate DNA specific for Alaska pollack (Theragra chalcogramma; 616 bp) and Atlantic cod (Gadus morhua; 361 bp) in accordance with the size of PCR product. Primer sets for gadid species determination were based on partial Panthophysin I (Pan I) genomic sequence. At less stringent conditions, Atlantic cod primers also amplified a fragment that has only a partial homology with other gadid species sequences deposited in GenBank. Due to this fact, two additional sets of overlapping primers were designed. The genomic sequence intotal lenghts of 1432 bp was acquired. Comparison with sequences of other gadid species revealed that our "unknown" sequence shares the highest homology with the sequence of North pacific hake (Merluccius productus). Within gained sequenc

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GM - Potravinářství

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QG60090" target="_blank" >QG60090: Alternativní metody pro monitorování autenticity potravin</a><br>

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

sborník VIII. Konference mladých vědeckých pracovníků s mezinárodní účastí

ISBN

80-7305-564-3

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

70-73

Název nakladatele

Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

—

Datum konání akce

—

Typ akce podle státní příslušnosti

—

Kód UT WoS článku

—